重庆两江新区工业园区位于两江新区东部，是两江新区成立后首次多区联动建设新区的试点，对今后新区建设具有示范意义。该园区规划建设用地约１７０平方公里，区内主要包括龙石先进制造功能区和鱼复现代物流功能区两大功能区。其中，龙石先进工业区规划建设用地１２０平方公里，区内将重点打造国家级重大电力装备基地风电发电机组系统集成，重点发展关键零部件及配套零部件制造；布局薄膜光伏产业集群，制造核电零部件，适时发展主装备和相关输配电设备；打造船舶制造基地，重点发展不锈钢化学船舶，液化石油及天然气船、中高档游艇等特种船舶及动力配套产品。鱼复现代物流功能区规划建设用地５８平方公里，计划打造西部最重要的水铁联运基地和港口物流集散地以及寸滩港部分保税功能转移主要承接地。

两江新区工业园区已启动轨道交通、风电装备和新能源汽车三大产业，目前，重庆长客城市轨道列车交通车辆公司已落户并建成投产；长安汽车微车和发动机部分项目已建成投产，还有近４０家配套企业即将入驻。

重庆两江新区工业园区将重点推动汽车产业、装备制造产业及物流产业的发展，并积极开展军工产业及高新产业的招商引资。按照规划，计划到２０２０年，将长安集团打造成中国乘用车第一自主品牌，形成５００万千瓦的风电生产能力，形成４００万千瓦的薄膜光伏产业生产能力，将果园港打造成为区域货运周转中心，形成年吞吐量１０００万吨。